Thomas Kelly entrou para o serviço diplomático dos Estados Unidos, em 1985. Serviu nas embaixadas americanas em São Salvador (1985-1987), Santiago (1990-1993), Paris (1994-1998), Quito (2000-2003), Vilnius (2004-2007) e Buenos Aires (2007-2010). Nas embaixadas em Vilnius e Buenos Aires, trabalhou como Ministro Conselheiro. Também trabalhou no Departamento de Estado como chefe da seção econômica e negócios (1988-1990) e no Escritório do Representante Comercial dos Estados Unidos -USTR (1998-2000).   

O Cônsul Geral Thomas Kelly é formado pela Escola de Diplomacia da Georgetown University, onde também mestrou-se em estudos latino-americanos, em 1984. É mestrado em desenvolvimento econômico pela Standford University, em 1994.  

Em 2003, o Departamento de Estado concedeu a Thomas Kelly o Prêmio Herbert Salzman pela Excelência no Desempenho Econômico Internacional, por seu trabalho desenvolvido no Equador. Também recebeu o Prêmio de Grande Honra, do Departamento de Estado, pelo serviço em seus últimos postos nos exterior. Foi indicado para receber o Prêmio Baker-Wilkins por Notável Ministro Conselheiro em 2005, 2006, 2008 e 2010.  

Thomas Kelly é natural da California, é casado e tem dois filhos. Fala espanhol, português, francês e lituano.